浙商证券 郭双喜 安柯 胡隽扬 行业研究 行业深度 AI制药行业深度报告：新时代，新跃迁

摘要

浙商证券提出AI4S行业进入新时代，药物研发逻辑正从科学家决策转向智能化自主决策验证，医药行业的"Claude时刻"即将到来。 技术层面，通用AI自2010年起以2-3年为一代完成四次迭代，每次突破后约1-2年渗透至制药领域，当前AI制药进入智能体与统一模型并进阶段，AlphaFold 2在CASP14实现原子级精度（中位GDT分数92.4、TM-score接近0.96），AlphaProteo在7个靶点湿实验成功率达88%，英矽智能TargetPro临床靶点检索率71.6%、较通用大模型提升2-3倍。 管线方面，截至2026年中全球超173个AI原创药物项目进入临床，其中15-20个预计2026年进入关键性临床试验，预计2026-2027年将有首个AI原创药物获批上市，AI发现分子临床一期成功率达80-90%、远超历史平均52%。 产业验证上，2025-2026年MNC合作转向平台级多年期绑定，首付款中枢跃升至5000万-1.15亿美元，2026年1月至8月出现8笔MNC Agent交易/部署；上游业绩同步爆发，Twist指引2026-2027年AI相关订单维持三位数增长，Recursion每周湿实验吞吐达2.2M次，金斯瑞预计AIDD订单未来几年保持三位数增长。 投资上，短期建议沿基因合成、蛋白表达与纯化、重组靶点蛋白、小分子合成、小鼠模型、临床前CRO等生命科学上游环节布局，长期关注能持续迭代的AI制药平台晶泰控股、英矽智能、剂泰科技、华兰股份等。 风险包括AI研发进展不及预期、行业竞争加剧、临床结果不及预期及国际关系紧张影响跨国合作。

主要观点

• 报告核心判断：AI4S行业进入新时代，行业发展逻辑从科学家决策转向智能化自主决策验证，多Agent+干湿闭环平台的价值在提升，医药行业的"Claude时刻"即将到来。

• 通用AI十年完成四次技术迭代（传统机器学习→深度学习→预训练大模型→智能体系统），每次突破后约1-2年核心技术渗透到制药垂直领域、再经2-3年进入产业落地验证期，AI制药整体略滞后于通用AI，目前进入智能体与统一模型并进阶段。

• 基础模型能力大幅跃迁：AlphaFold 2基于Evoformer架构在CASP14实现原子级精度突破，中位GDT分数达92.4、TM-score接近0.96；RFdiffusion2为全部41个活性位点成功生成支架结构，而此前方法仅能完成16个。

• 生成式AI从"理解已知"进入"创造未知"：ESM3（98B参数多模态蛋白质语言模型）生成esmGFP全新荧光蛋白，与已知荧光蛋白序列相似性仅58%、约等效5亿年自然进化；AlphaProteo在7个靶点测试中湿实验成功率高达88%，平均结合强度比现有最佳办法高出10倍。

• 英矽智能TargetPro（2025年8月公布，覆盖肿瘤、代谢、免疫、纤维化、神经五大类共38种疾病）靶点发现能力明显强于通用大模型：在TargetBench 1.0上临床靶点检索率71.6%，较GPT-4o、DeepSeek-R1等（15%–40%）和Open Targets（<20%）提升2–3倍。

• 单点基础模型存在五大结构性问题：干湿实验脱节、阴性数据严重缺失、流程碎片化、生物学黑箱、监管约束；Benchmark跑分持续走高但迁移到真实项目性能大幅衰减，换到全新靶点性能断崖下跌。

• 多Agent+干湿闭环成为新范式：Robin多智能体系统在dAMD老药新用任务中将人工需359-424小时的完整科研认知工作流压缩至30分钟，单轮API成本仅10.76美元，输出候选利帕舒地尔经湿细胞实验验证增强RPE吞噬活性，而通用Deep-Research Agent输出的17个候选全部无活性。

• 平台化带来发现端效率革命：以英矽智能为例，AI药物研发平台将临床前候选药物成本从4亿美元以上降至300-500万美元，研发周期从4年以上缩短至12-18个月，所需合成分子数从约1000个降至60-200个。

• 临床管线验证的是基模而非平台：截至2026年中全球超173个AI原创药物项目进入临床，AI发现分子临床一期成功率达80-90%、远超历史平均52%，肿瘤占比约40%、CNS约20%、自免约15%；但现有管线技术集中于2023年及以前的单点模型，Recursion OS 2.0、AI co-scientist、LabClaw、XtalPi Science等新范式平台的管线尚未进入临床验证阶段。

• MNC从买单管线转向购买平台能力：2025-2026年合作案例转向平台级、多年期、全能力绑定，首付款中枢跃升至5000万-1.15亿美元；石药×阿斯利康首付款1.1亿美元、总金额最高53.3亿美金，英矽智能×礼来首付款1.15亿美元、总额最高27.5亿美元；2026年1月至8月共8笔MNC Agent交易/部署且集中在4-6月爆发。

• 湿实验验证产能加速扩张印证行业爆发：Recursion专有数据量达65PB、每周湿实验吞吐2.2M次；百图生科×和铂医药共建干湿结合发现实验室预计实验效率提升500%、合作管线从10余个扩充到百余个；英矽智能LabClaw由5个协作式AI智能体与28项专业技能模块构成；剂泰科技IPO募资中9770万港元用于扩大高通量湿实验室。

• 上游业绩率先兑现：Twist 2025年AI相关订单额2500万美元，公司指引2026、2027财年均达成甚至超越AI赋能药物研发订单三位数增长，即2026财年至少5000万美元、2027财年达1亿美元，2026年收入指引4.56-4.57亿美元、毛利率超52%；金斯瑞2026H1 Gene-to-Protein业务收入占生命科学业务66%，AIDD订单预计2026年下半年及未来几年保持三位数增长。

论述逻辑

• 通用AI十年四次技术迭代→每次突破后1-2年渗透到制药垂直领域、2-3年进入产业落地验证期→生物化学基础模型能力跃迁（AlphaFold系列实现原子级精度、AlphaProteo成功率88%、TargetPro检索率71.6%）→但单点模型存在干湿脱节、阴性数据缺失、流程碎片化等五大结构性问题→多Agent+干湿闭环平台成为新范式，将药物发现从低频验证转向高频、高通量、多轮快速迭代→MNC平台级大额订单（首付款5000万-1.15亿美元）与Twist、金斯瑞等上游公司业绩爆发，标志范式变革从理论研究进入落地验证阶段→DBTL闭环加速带来分子筛选量价跨越→短期验证阶段需求井喷利好生命科学上游产业链，长期持续迭代的平台能力提升并建立壁垒→医药行业的"Claude"即将到来，部分企业或成为制药板块的"Anthropic"

关键展望

• 预计2026-2027年将有首个AI原创药物管线获批上市，其中15-20个项目预计在2026年进入关键性临床试验阶段。

• Twist指引2026、2027财年均达成甚至超越AI赋能药物研发订单三位数增长，2027财年AI订单将从5000万美元增至1亿美元。

• 金斯瑞预计AIDD相关订单将在2026年下半年以及未来几年保持三位数百分比增长趋势，AI相关蛋白业务占比预计快速提升。

• 长期看，随着DBTL闭环加速循环，头部企业围绕垂直类基础模型+智能体调用平台+干湿闭环持续迭代，AI制药平台价值将从biotech转向行业基础设施，部分企业或有机会成为制药板块的"Anthropic"。

• 新范式平台管线尚未进入临床验证，需要从更早阶段观察平台能力变化和市场认可程度。

• 风险提示：AI制药研发进展可能不及预期、行业竞争可能加剧、临床试验结果可能不及预期、国际关系紧张可能导致跨国合作进度不及预期。

推荐标的

• 基因合成（AI设计序列后需构建DNA并完成基因/质粒合成）：关注金斯瑞生物科技、义翘神州、百普赛斯、和元生物。

• 蛋白表达与纯化（培养基及层析填料/色谱介质）：关注奥浦迈、纳微科技、赛分科技。

• 重组靶点蛋白/细胞因子（体外细胞实验重要检测工具）：关注百普赛斯、近岸蛋白、义翘神州、皓元医药、诺唯赞、优宁维。

• 小分子合成（分子砌块、高端化学试剂、定制合成）：关注毕得医药、皓元医药、昊帆生物、阿拉丁、泰坦科技。

• 小鼠模型（体内药效、PK/PD验证，人源化小鼠需求不可替代）：关注百奥赛图、药康生物、南模生物。

• 临床前CRO（合成测试需求提升，安评需求随分子向PCC后传导提升）：关注药明康德、康龙化成、药明生物、药明合联、昭衍新药、益诺思、美迪西。

• 临床CRO（远期AI替代可能性较低，早期分子向IND传导后有望受益）：关注泰格医药、普蕊斯、诺思格。

• 长期主线——能持续迭代的AI制药平台（DBTL闭环加强后业绩和估值有望重估）：晶泰控股、英矽智能、剂泰科技、华兰股份等。

• 晶泰控股：基模+智能体平台+干湿闭环全面布局，基模覆盖小分子、大分子、多肽、小核酸等垂类，通过自研+合作开发19条管线，下游延伸药品+新材料+消费健康。

• 剂泰科技-P：NanoForge平台围绕纳米材料构建基模+智能体调用+干湿闭环，目前拥有14条管线覆盖多个疾病类型，IPO募资中9770万港元将用于扩大高通量湿实验室。

• 金斯瑞生物科技：Gene-to-Protein全球领先的规模通量和交付速度，最快4天内完成从序列到模型数据交付；2026H1该业务收入占生命科学业务66%，AIDD客户具备高通量、高频次、长期合作特点。

• 百奥赛图：全球稀缺的全人源小鼠平台龙头，受益体内验证需求爆发；RenSuper Workstation整合千鼠万抗积累的数亿级真实全人抗体序列数据与高通量自动化验证体系；报告未对上述标的给出评级与目标价，均为"关注"建议。